В университете осуществляется целенаправленная и системная воспитательная работа, а также идеологическое сопровождение учебного процесса.
Воспитательной работой со студентами занимаются: отдел по воспитательной работе с молодежью, кураторы студенческих организаций, заместители деканов по воспитательной работе. Непосредственное руководство работой осуществляет проректор по воспитательной и социальной работе.
Информационно-воспитательная работа проводится по следующим направлениям:
— формирование гражданских и моральных качеств, патриотическое и трудовое воспитание;
— активизация учебной деятельности студентов, совершенствование практической подготовки будущих врачей;
— эстетическое воспитание и организация свободного времени;
— физкультурно-оздоровительная и спортивная работа;
— социально-психологическая работа;
— воспитательная работа в общежитиях.
Отдел по воспитательной работе со студентами осуществляет практическую деятельность по организации и координации воспитательной работы согласно Концепции воспитательной работы в КазНМУ им. С.Д. Асфендиярова, утвержденного стратегического плана воспитательной и социальной работы в вузе, плана работы на факультетах, кафедрах и в общежитиях университета.