Клиникалық жұмыс бойынша департаментқұрылымына келесі құрылымдық бірліктер кіреді:
- Емдеу-диагностикалық және алдын алу жұмыстарын координациялау бойынша бөлім;
- Клиникалық базаларды (соның ішінде аймақтық) бақылау және мониторингі бойынша бөлім.
Клиникалық жұмыс бойынша департаментқұрылымына келесі құрылымдық бірліктер кіреді: